b超无害从原理上分析，b超是超声传导，不存在电离辐射和电磁辐射，是一种声波传导，这种声波对人体组织没有什么伤害。但如果声波密集在某一固定地方，又聚集很长时间的话，就会有热效应，这种热效应达到一定程度时，可能会对人体组织产生不良影响，影响细胞内的物质，包括染色体。
理论上是高强度的超声波可通过它的高温及对组织的腔化作用，对组织产生伤害。事实上，医学使用的b超是低强度的，低于94毫瓦/立方厘米，对胎儿是没有危害的，至今尚没有b超检查引起胎儿畸形的报道。目前，各医院在产科领域中使用的b超检查对胎儿是安全的。
在整个怀孕期间，早、中、晚期各进行一次b超检查是必要的。然而有些人对做b超的目的不明确，为了弄清楚孩子的性别，不惜到多家医院反复进行b超检查。这对母婴均不利。
很多超声专家也提醒人们，与过去相比，现在孕妇接受超声检查的机会明显增加了，并且随着人们对超声检查精确度要求的不断提高，现在产科超声检查的能量是十几年前的8倍之多。而所谓的三维”、四维”b超，能量比普通二维超声更高。有些诊疗机构还提供为胎儿照相甚至录像的有偿服务，这又增加了胎儿暴露在超声中的时间。专家认为虽然目前没有超声检查有害胎儿健康的证据，但是尽量减少胎儿的超声暴露还是必要的。
一般认为b超是一种非侵入性的、对受检者无损害的检查，特别是相对于X线、核磁共振等检查仪器来说，b超对人体是较为安全的。但超声波毕竟也是一种能量形式，达到一定剂量时受检者体内会产生生物效应，使发生生物效应的局部细胞受到损害。
国外已经有资料证明b超对胎儿有损害。有专家选择怀孕7―8周并准备做人流的妇女，按其做b超检查时间长短分为1分钟、3分钟、10分钟3个组进行对照观察。结果发现，做b超检查之前，这些孕妇体内的胚胎发育都很好；而做了b超检查以后，除1分钟的5例无变化外，其余的胚胎的绒毛发生了变形，表现细胞排列紊乱，细胞内出现泡状结构，进一步的发展还可使胎儿畸形或发生流产。很明显，b超对胚胎照射的时间越长造成的不良影响就越大。
在人体的多数器官中，损伤几个细胞无关紧要，但如果是损害了生殖细胞或处于发育敏感阶段的胚胎，则其后果是严重的。所以，孕期做b超尽量不要超过3次。早孕期间做妇产科b超对新生儿有一定影响，而妊娠中晚期做过妇产科b超的新生儿未见不良影响。因此，早孕期的妇产科b超检查应该谨慎使用。